|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
“GENETİK TİPLENDİRMEDE PCR
UYGULAMALARI” Uygulamalı Eğitim Programı 13-15 Ekim 2004 Yer İstanbul
Üniversitesi Moleküler
Biyoloji ve Genetik Bölümü Düzenleyen Kuruluş İstanbul Üniversitesi Biyoteknoloji
ve Genetik Mühendisliği Araştırma ve Uygulama Merkezi (BİYOGEM)
Düzenleme Kurulu: Prof. Dr. Güler Temizkan Prof. Dr. Şule Arı Doç. Dr. Ayşegül Topal
Sarıkaya Doç. Dr. Nazlı Arda Yard. Doç. Dr. Filiz
Gürel Yard. Doç. Dr. Gülruh
Albayrak
Organizmaların genetik düzeyde
tiplendirilmesi, pek çok biyoteknolojik ve moleküler çalışmanın temelini
oluşturmaktadır. Bu uygulamaların başında türlerin ve alt türlerin genetik
olarak tanımlaması ve çeşitliliğin ortaya konması gelir. Bu çalışmalardan
elde edilen bulgular aynı türe ait bireylerin evrimsel geçmişinin
araştırılmasında da sıkça kullanılmaktadır. Özellikle genom araştırmalarının
hız kazandığı günümüzde, genetik tiplendirme yöntemlerinin biyoloji, tıp,
veterinerlik ve ziraat gibi pek çok alandaki çalışmalara yansıması
kaçınılmazdır. Bakterilerden insana kadar her tip
organizmanın genetik tiplendirilmesinde en hızlı, ekonomik ve güvenilir
uygulamalar Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PCR)’na dayalı yöntemlerdir.
İstanbul Üniversitesi Biyoteknoloji ve Genetik Mühendisliği Araştırma ve Uygulama Merkezi (BİYOGEM)’nin
düzenlediği “Genetik Tiplendirmede PCR
Uygulamaları” ülkemizdeki araştırmacılara, kısa bir zamanda genetik
tiplendirmedeki son gelişmeleri teorik ve uygulamalı olarak vermeyi amaçlamaktadır.
Kursa katılım 20 kişi ile sınırlı tutulacaktır. PROGRAM ·
· Moleküler
çeşitlilik ve tiplendirme analizleri: Lokusa bağlı RFLP, AFLP, CFLP, DNA Dizi
Analizi, Mikroçip uygulamaları. ·
· Genomik
DNA izolasyonu ·
· RAPD
ile tiplendirme ·
· Bakterilerin
koloni PCR ile tanımlanması ·
· REP/BOX-PCR
uygulamaları Başvuru
formunu doldurup en geç 30 Haziran 2004 akşamı elimize ulaşacak şekilde
posta, faks veya e-posta yoluyla aşağıda belirtilen adrese yollayınız.
Başvuru değerlendirmesinin sonuçları en geç Temmuz ayının son haftası tarafınıza
bildirilecektir. Katılım ücretinin son ödeme tarihi 17 Eylül 2004’dür
Yazışma
Adresi : Yard. Doç. Dr. Filiz Gürel İstanbul Üniversitesi Fen Fakültesi Moleküler
Biyoloji ve Genetik
Bölümü 34118 Vezneciler İstanbul Telefon : 0212- 455 57 00 / 15110 Faks : 0212-440 00 92 0212-528 05 27 e-posta :
filiz@istanbul.edu.tr
Sayın Meslektaşımız, Marmara Üniversitesi Mühendislik
Fakültesi ile İstanbul Üniversitesi Biyoteknoloji ve Genetik Mühendisliği
Araştırma ve Uygulama Merkezi (BİYOGEM) 16-18 Ağustos 2004 tarihleri arasında
"Protein Kütle Spektrofotometrisi ve Proteomik" konulu bir
Workshop düzenleyeceklerdir. Davetli öğretim üyesi Prof.
Dr. Alastair Aitken (University of Edinburgh, Division of Biomedical and
Clinical Laboratory Sciences) tarafından hazırlanan program çerçevesinde,
teorik olarak gerçekleştirilecek bu etkinliğin, konu ile ilgili alanlarda
çalışan ve kısmen deneyim sahibi genç araştırmacılara etkin bir işbirliği ve
tartışma ortamı yaratması hedeflenmektedir. Bu programın diğer bir amacı da,
Marmara Üniversitesi Mühendislik Fakültesi bünyesinde hizmete girecek
proteomik sisteminin (Waters, Micromass Q-Tof Micro Mass Spectrometer)
işletimi ile ilgili ulusal bir platform oluşturulmasıdır. Katılımın ücretsiz olacağı bu
etkinliğin dili İngilizcedir. Katılımcı sayısı 15 kişi ile
sınırlandırılmıştır. Konaklama ve yemek giderleri katılımcılar tarafından
karşılanacaktır. Konu başlıkları aşağıda belirtilmiştir. Başvuru formu
ektedir. Son başvuru tarihi 5 Temmuz 2004’tür. Düzenleme
Kurulu Prof.
Dr. Ahmet Alp SAYAR* Prof.
Dr. Güler TEMİZKAN** Doç.
Dr. Dilek KAZAN* Doç.
Dr. Nazlı ARDA** Y.
Doç. Dr. Ebru TOKSOY ÖNER* Aydan
SALMAN DİLGİMEN (MSc)* * Marmara Üniversitesi Mühendislik Fakültesi ** İstanbul Üniversitesi BİYOGEM KONULAR
ü Introduction
to protein mass spectrometry and proteomics (Protein kütle
spektrometrisi ve proteomik kavramına genel bakış) ü 2-D
gels and staining techniques (İki boyutlu jeller ve
boyama teknikleri) ü Sample
preparation for mass spectrometry [including in-gel digestion; gel staining
sensitivity and sample recovery from 1- and
2-D gels; mass spectrometry sample preparation from HPLC (for modified
peptides); sample clean-up by Zip-tips, (including MC zip-tips for phosphopeptides)]. (Kütle
spektrometri için örnek hazırlama (jel içinde parçalama, jel boyama
duyarlılığı ve örneğin 1- ve 2- boyutlu jellerden geri kazanımı, HPLC ile
ayrılan modifiye peptitlerin MS için hazırlanması, Zip uçlarıyla örnek
temizleme ve fosfopeptitlere uygulanması) ü MS
techniques (MS teknikleri) Maldi-tof (Matriks destekli lazer
dezorpsiyon - iyonizasyon- uçuş zamanlı kütle spektrofotometrisi) ü Electrospray
and ion-trap (Elektrosprey ve iyon
kapanı) ü MS/MS
(tandem MS sequencing) [MS/MS (ardışık MS'lerle
dizileme)] ü On-line
MS techniques (Sanal ortamda uygulanan
MS teknikleri) ü Mass
spectrometry of large protein complexes (Büyük protein
komplekslerinin kütle spektrometrisi) ü Identification
of post- translational modifications (Translasyon sonrası
modifikasyonların belirlenmesi) ü HPLC
(includes emphasis on analysis of post-translational modifications) [HPLC (Translasyon sonrası modifikasyonların
analizinde kullanılması)] ü Phosphorylation/glycosylation/acylation
etc. and confirmation of sites of phosphorylation by automated Edman degradation
by solid phase on automated sequencer (Fosforilasyon/
glikozilasyon/ açilasyon vb. ve fosforilasyon bölgelerinin otomatik dizileme
aletinde, katı fazda Edman yıkımı ile doğrulanması) ü Squence
tag and ICAT methodologies (Dizi etiketleme ve ICAT
yöntemleri) ü Computing/bioinformatics (Bilgisayar
teknolojilerinden yararlanma ve biyoinformatik) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
