Prof. Dr. Baki Akkuş 1959 yılında Mersin'de doğdu. İlk öğrenimini Mersin Necatibey İlkokulunda, orta ve lise öğrenimini Mersin Tevfik Sırrı Gür Lisesinde tamamladı. 1984 yılında İstanbul Üniversitesi Fen Fakültesi Fizik Bölümü'nden mezun oldu. İstanbul Üniversitesi Fen Fakültesi Fizik Bölümü Nükleer Fizik Anabilim Dalı'nda 1987 yılında Yüksek Lisansını ve 1991 yılında Doktorasını tamamladı. 1985 yılından bu yana Fen Fakültesi Fizik Bölümü Nükleer Fizik Anabilim Dalında çalışan Prof. Dr. Baki Akkuş, 1996'da Doçent ve 2001 yılında Profesör oldu.

1990-1991 yılları arasında Cenevre / İsviçre'de bulunan Avrupa Nükleer Araştırma Merkezi (CERN) CHARM-II ve CHORUS deneylerine araştırıcı olarak katıldı. 

1998, 1999, 2001 yıllarında Güney Afrika Cumhuriyeti,  Cape Town - Ulusal Hızlandırıcı Merkezi'nde, 1998 yılında Leuven Üniversitesi / Belçika Nükleer Fizik Enstitüsü'nde, 2001 ve 2004 yıllarında Yale Üniversitesi / Amerika Birleşik Devletleri A. W. Wright Nükleer Yapı Fiziği Laboratuarında deneylere katıldı. 1995, 1998 ve 2002 yıllarında Sofya Üniversitesi / Bulgaristan Nükleer Fizik Bölümünde bilimsel çalışmalar yaptı.

Akademik hayatı boyunca yürütücü ve araştırıcı olarak 8 adet ulusal ve uluslararası projede görev aldı. Bu projelerden Türk Hızlandırıcı Merkezi Projesinin (THM) Proton Hızlandırıcısı Grubunun Yürütücüsü ve İstanbul Üniversitesi Sorumlusudur ve Türkiye Atom Enerjisi Kurumunda (TAEK) yürütücüsü olduğu projeleri halen devam etmektedir. Ayrıca Türkiye Atom Enerjisi Kurumunun TAEK-CERN Bilim Komitesi Üyeliği, İstanbul Üniversitesi Bilimsel Araştırma Projeleri Komisyon Üyeliği, İstanbul Üniversitesi Akademik Yapılanma Sürekli Komisyon Üyeliği ve İstanbul Üniversitesi İleri Analizler Laboratuarı Danışma Kurulu Üyeliği görevlerini de sürdürmektedir.

Bilimsel çalışmaları neticesinde Prof. Dr. Baki Akkuş'un 19 tanesi SCI Expanded kapsamındaki dergilerde olmak üzere toplam 29 adet makalesi bulunmaktadır ve SCI kapsamındaki bilimsel dergilerden yayınlarına 165 adet atıf almıştır. Ayrıca çok sayıda Uluslararası ve Ulusal Bildiri, Poster, 2 adet Kitap Bölüm Çevirisi bulunmaktadır. Prof. Dr. Baki Akkuş danışmanlığında 8 öğrenci Yüksek Lisans, 3 öğrenci doktorasını tamamladı ve halen 2 Yüksek Lisans ve 3 doktora öğrencisinin danışmanlığını sürdürmektedir.

Bilimsel çalışmalarının yanı sıra çok sayıda uluslararası ve ulusal bilimsel toplantılarda Danışma Kurulu, Bilim Kurulu, Düzenleme Kurulu Başkanlıkları ve üyelikleri yapmıştır. Ayrıca 100 kadar uluslararası ve ulusal bilimsel toplantılar düzenlemiş ve düzenlemeye devam etmektedir.

1994 ve 1995 yıllarında İstanbul Üniversitesi, Araştırma Fonu'ndan Başarılı Araştırmacı Belgesi Ödülleri,  1996 yılında İstanbul Üniversitesi Prof. Dr. Nazım Terzioğlu Bilim Ödülü ve 2003 yılında Akdeniz Gazeteciler Derneği Yılın Bilim Adamı Ödülünü almıştır.

Ayrıca Türk Fizik Derneği Genel Başkan'lığı görevinin yanında Balkan Fizik Birliği ve Avrupa Fizik Derneği'nin de üyesi olan Prof. Dr. Baki Akkuş'un TÜBİTAK Doğa Dergisinde Hakemliği, Süleyman Demirel Üniversitesi, Fen - Edebiyat Fakültesi, Fen Dergisinde Yayın Kurulu Üyeliği, Annals of Academy of Romanian Scientists, Physics Series de Yayın Kurulu üyeliği ve Valahia Üniversitesinde Yayın Kurulu üyeliği bulunmaktadır.

Prof. Dr. Baki Akkuş 1997 - 2000 ve 2000 - 2002 yılları arasında toplam 6 yıl Fen Fakültesi Yönetim Kurulu Üyeliği ve 2001 - 2004 ve 2005 - 2007 yılları arasında iki dönem toplam 6 yıl da Nükleer Fizik Anabilim Dalı Başkanlığı yapmıştır.

16.04.2009 tarihinden itibaren Fen Fakültesi Dekanı olarak görev yapmaktadır.

İngilizce bilen Prof. Dr. Baki Akkuş, evli ve iki çocuk babasıdır.